Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA9P31269 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA9P31269 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms