Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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