Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYF6P23409 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms