Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD247P20963 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms