Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA2P17301 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms