Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC130P13994 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms