Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DOBP13765 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms