Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms