Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFTRP13569 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFTRP13569 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CFTRP13569 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFTRP13569 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFTRP13569 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CFTRP13569 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFTRP13569 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms