Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLBP1P12271 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms