Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYBBP04839 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYBBP04839 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYBBP04839 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms