Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG7O95352 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG7O95352 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG7O95352 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG7O95352 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG7O95352 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG7O95352 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms