Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms