Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PPFIA3O75145 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA3O75145 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms