Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN2BO60939 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms