Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAG9O60271 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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