Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALUO43852 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALUO43852 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALUO43852 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALUO43852 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms