Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNQ3O43525 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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