Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYNJ1O43426 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNJ1O43426 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms