Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA5O15230 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA5O15230 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms