Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BCKDKO14874 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms