Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9YO00507 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP9YO00507 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP9YO00507 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP9YO00507 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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