Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3C2AO00443 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms