Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOC4-APOC2K7ER74 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms