Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3QRK9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3QRK9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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