Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms