Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms