Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT87PA6NCN2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms