Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms