Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YBX2Q9Y2T7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YBX2Q9Y2T7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms