Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms