Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms