Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CGGBP1Q9UFW8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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