Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms