Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJB9Q9UBS3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJB9Q9UBS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms