Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPB1Q9UBR1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms