Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TFIP11Q9UBB9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TFIP11Q9UBB9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms