Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIAA1549Q9HCM3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIAA1549Q9HCM3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms