Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLIRPQ9GZT3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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