Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TBC1D2Q9BYX2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms