Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YTHDF1Q9BYJ9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YTHDF1Q9BYJ9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms