Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCGF6Q9BYE7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms