Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPL3Q9BY60 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms