Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC4A5Q9BY07 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms