Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms