Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms