Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNN2Q99439 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.8 ms