Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF607Q96SK3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms