Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CICQ96RK0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms