Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms